Disciplina - detalhe

LZT5759 - Análise de Comunidade Microbiana


Carga Horária

Teórica
por semana
Prática
por semana
Créditos
Duração
Total
16
8
4
2 semanas
60 horas

Docentes responsáveis
Aline Silva Mello Cesar
Luiz Lehmann Coutinho

Objetivo
Capacitar os alunos nas metodologias de bioinformática envolvidas na análise de comunidade microbiana.

Conteúdo
Introdução, introdução a linha de comando, introdução ao R, tecnolgias de sequenciamento, amplificação de comunidade microbiana, processamento de dados, desenho experimental, pacote Phyloseq.

Bibliografia
McMurdie, P. J. & Holmes, S. phyloseq: an R package for reproducible interactive analysis and graphics of microbiome census data. PloS one 8, e61217 (2013).