Carga Horária
Teórica por semana |
Prática por semana |
Créditos |
Duração |
Total |
16 |
8 |
4 |
2 semanas |
60 horas |
Docentes responsáveis
Aline Silva Mello Cesar
Luiz Lehmann Coutinho
Objetivo
Capacitar os alunos nas metodologias de bioinformática envolvidas na análise de comunidade microbiana.
Conteúdo
Introdução, introdução a linha de comando, introdução ao R, tecnolgias de sequenciamento, amplificação de comunidade microbiana, processamento de dados, desenho experimental, pacote Phyloseq.
Bibliografia
McMurdie, P. J. & Holmes, S. phyloseq: an R package for reproducible interactive analysis and graphics of microbiome census data. PloS one 8, e61217 (2013).