LGN5833 - Banco de Dados e Ferramentas Computacionais Aplicados à Genômica

Carga Horária

Docentes responsáveis
Claudia Barros Monteiro Vitorello
Douglas Silva Domingues

Objetivo
A disciplina deverá fornecer ao aluno de pós-graduação uma visão geral sobre os fundamentos para a
análise e anotação de genes e genomas, anotação de proteínas, utilizando bancos de dados e
ferramentas computacionais disponíveis on-line ou de fácil acesso.

Conteúdo
Introdução à genômica. Genomas de procariotos e de eucariotos. Organização, propriedades e evolução
de genomas. Tecnologia do sequenciamento de DNA e estratégias de sequenciamento. Princípios da
predição de genes em procariotos e eucariotos. Anotação de genomas. Banco de dados biológicos
primários e secundários (Bancos de dados de sequências de nucleotídeos, proteínas, domínios, função,
estrutura, organismo-específicos, função-específicos e outros). Acesso aos bancos de dados NCBI e
EMBL. Anotação funcional de proteínas. UniProt. Ontologias. Domínios funcionais. Métodos de busca por
similaridade de sequências. Métodos de alinhamento local, global e de dados de sequenciamento de
nova geração. Ferramentas computacionais disponíveis on-line. Análises comparativas.

Bibliografia
Introdução a Bioinformática. Arthur M. Lesk. 2.ed. Editora Artmed. 2008. ISBN 978-85-363-1104-3.
Computing for Comparative Microbial Genomics. David W. Ussery; Trudy M. Wassenaar; Stefano
Borini.1.ed. Springer. 2009. ISBN 978-1-84800-254-8. Bioinformatics and Functional
Genomics.Jonathan Pevsner. 2.ed. Wiley-Blackwell. 2009. ISBN 978-0-470-08585-1. Artigos científicos
de revisão que devem ser lidos semanalmente de periódicos importantes na área